Moğollar Pekin’e ilerlerken Pekin şehrinin savunması da ancak bu yıllarda iyi bir hale gelebildi. Çünkü Pekin şehrinin savunmasına o yıllara kadar pek fazla önem verilmemişti. Ancak Moğolların geliyor olmasıyla 1540’lı yıllarda inanılma bir hızla gelişti.

Pekin şehrinin savunmasında yapılan duvarlara ve kulelere ateşli silahlar bile konulmuştu ki bu o günler için bir ilkti. Pekin şehrinin savunması 1548 yılında bitmişti ama buna rağmen bu tarihten sonra duvarlar hala artırılmaya devam edildi. Duvarlar bazı bölümlerde iki kat çekilirken bazı bölümlerde üç bazılarında ise dört kat bile çekildi. Ancak Çinliler bununla da kalmadı ve bazı bölümlerde duvarlar ağaçlandırılarak daha da kuvvetlendirildi.