Preveze Savaşı, daha sonra 1571 'de Osmanlı donanmasının yok edildiği İnebahtı Savaşı gibi büyük bir deniz savaşı değildir. Ancak bu savaştan sonra çeyrek asır boyunca, Osmanlı Akdeniz'de üstünlüğü elinde tutmuştur.

Öte yandan, Amerikalı Albay B. Taylor, Preveze Savaşı'nın Doria ile Barbaros arasında “danışıklı dövüş” olduğunu iddia etmiştir. Ancak bu iddianın aslı yoktur. Bir diğer iddia da Barbaros'un İspanyollarla iş birliği ortamı aradığıdır. İspanya arşivinde bulunan bir belgeye göre, 25 Eylül tarihinde, Alarcon adlı bir İspanyol ajanı Barbaros'a bir mektup yazarak Afrika'daki bazı topraklarla Trablusgarb karşılığında, Osmanlı hizmetinden çıkarak Cezayir'e dönmesini talep etmişti.

Barbaros'un cevabında ise, eğer İspanya, Venedik'e karşı savaşırsa yardımcı olacağı be­lirtiliyordu. Bu yazışmaların doğruluk derecesi tam olarak tespit edilememiştir.