1092 yılında Ebul Kasım Emir Bozan ile görüşmek için yola çıktığında Emir Bozan tarafından öldürüldü. Anadolu Selçuklu Devleti’nde onun yerine kardeşi Ebul Gazi geçti. Ancak 1092 yılında bir isim daha hayatını kaybetti ve bu tüm Selçuklu Devleti’ni ateşe atacak olan olaylar zincirini başlattı.

O olay ise Selçuklu Sultanı 1. Melikşah’ın ölmesiydi. 1. Melikşah’ın ölmesi ile Büyük Selçuklu Devleti içinde taht kavgaları başladı. Bu olaylar Büyük Selçuklu Devleti’nin otoritesini zayıflatınca Büyük Selçuklu Devleti’ne bağlı olan Anadolu Selçuklu Devleti de artık Büyük Selçuklu Devleti’ne bağlı olmayan bir konuma gelmiş oldu. Böylece Anadolu Selçuklu Devleti bağımsızlığını kazandı. Tıpkı Büyük Selçuklu Devleti’ne bağlı olan diğer devletler gibi.