Tahta çıktığında I. Murad'ın hayatta iki kardeşi vardı: Halil ve İbrahim. Bunlardan Halil, Orhan Gazi'nin eşlerinden Theodora'dan doğmuştu. Theodora, daha önce Bizans İmparatorluğu yapmış olan Kantakuzenos'un (VI. Ioannes 1341-1355) kızıydı. Şehzade Halil, aynı zamanda Kantakuzenos ile ortak Bizans İmparatoru olmuş V. Ioannes'in (Paleologos; 1341-1376 ve 1379- 1391) on yaşındaki kızı ile Mart 1359'da nişanlanmıştı.

Bursa sancak beyliği yapan Şehzade Halil'in babası I. Murad tarafından çok sevildiği ve Osmanlı tahtına aday olarak gösterildiği rivayetleri vardır. Hayattaki diğer şehzade İbrahim'in de, I. Murad'dan daha büyük olduğu muhtemeldir.

I. Murad, Ankara'yı geri aldıktan sonra, Eskişehir civarına yönelerek, bu bölgede bulunan kardeşlerini ortadan kaldırdı. Osmanlı tarihleri, bu olay hakkında fazla bilgi yoktur. Şehzadelerin isyan ettiklerine dair kimi kayıtlar vardır. Bu iki şehzadenin öldürülmesiyle, Hanedan ‘da ilk kez kardeş kanı akıtılmıştır.