Cenevizlilerin elinde bulunan Amasra 1459'da fethedildi. 1461 'de, Batı Karadeniz'deki Candaroğulları Beyliği ile Trabzon Rum İmparatorluğu ortadan kaldırıldı. Osmanlı'nın ezeli düşmanı Karamanoğulları Beyliği'nde ki taht çekişmesi, Akkoyunlular ile Osmanlıları karşı karşıya getirdi. Akkoyunluların işe karışması ve kardeşlerden Pir Ahmed Bey'in yardım istemesi üzerine Osmanlı da, duruma müdahale etti.

 

Osmanlı kuvvetleri karşısında yenilen İshak Bey, hamisi Uzun Hasan'ın yanına kaçtı. İshak Bey tarafından Osmanlılara teklif edilen iki şehir ile Sıklan Hisarı ve Ilgın kaleleri dışındaki tüm diğer topraklar, Pir Ahmed'e verildi.

Osmanlı desteğiyle kısa sürede kardeşi İshak'ı mağlup eden Pir Ahmed, Karaman Beyi olmuştu. Ancak bir süre sonra bütün Karaman beyleri gibi Pir Ahmed’de Osmanlı aleyhine çalışmaya başladı. Fatih Sultan Mehmed, 1465 yılının sonbaharında Anadolu'ya geçti. Pir Ahmed, kaçarak kendini Larende'ye kapattı. Veziriazam Mahmud Paşa ancak zorlu bir mücadeleden sonra onu bu son sığınağından da kaçırdı, Bunun üzerine Pir Ahmed Bey de Varsak ve Turgut gibi Türkmen aşiretlerinin yaşadığı Toroslar’a sığındı, 1467'de Uzun Hasan, Maveraünnehr'in büyük hüküm darı Ebu Said'e karşı önemli bir zafer kazandı, Ebu Said Han öldürüldü.

Bu zaferden sonra konumu değişen Uzun Hasan, himayesine aldığı Karamanoğullarının hakkını korumak için harekete geçti. Karamanoğlu Pir Ahmed, Karaman Beyliği topraklarına geri döndü ve eski Veziriazam Rum Mehmed Paşa ile çarpıştı. Karaman Türkmenleri beylerinin yanında savaşmaya başladığından, bölgedeki Osmanlı güçleri Pir Ahmed'e karşı çok fazla bir şey yapamadı. Bunun üzerine Bosna Sancakbeyi İshak Bey Anadolu'ya çağrıldı. İshak Bey, kısa bir süre sonra Pir Ahmed'i ve müttefiki olan kardeşi Kasım'ı mağlup etti. Karaman hüküm darlarının yeni başkenti Aksaray da, Konya'nın akıbetine uğradı.1474'te Gedik Ahmed Paşa, Anadolu birlikleri ile Ermenek'i, Minan'ı ve son olarak Silifke'yi almayı başardı.