Napolyon Akka’yı kuşattıktan bir buçuk ay kadar sonra her şeye rağmen başarı elde etmeyi başarmıştı. Fransız askerleri kaleden içeri sızıp Akka şehrine girmeyi başarmıştı. Ancak Fransız askerlerinin şehre girdiği bölgede bir cephaneliğin patlaması sonucu Fransız saldırısı oldukça yavaşlamıştı. Bir an için Cezzar Ahmet Paşa’ya yardım için Fransız ordusunu denizden top atışına tutan İngiliz Amirali Nelson bile Akka Kalesi’nin Fransızlar tarafından ele geçirildiğine inanmış ve kısa bir süreliğine top atışını kesmişlerdi. Fransız askerlerinin yavaşlamasıyla Osmanlı askerleri ile Fransa askerleri arasında mücadele devam etti. Fransızlar şehre girmeyi başardıktan 1 – 2 hafta kadar sonra ise Cezzar Ahmet Paşa’ya yardıma 3000 Nizam – ı Cedid askeri geldi. Bu durum Fransa ordusunda büyük bir moral bozukluğuna sebep olmuştu.

Fransa ordusunun moralinin bu kadar bozulmasının üzerine bir de Fransa ordusu içinde veba salgını başladı. 270 kadar Fransa askeri bu salgında hayatını kaybetti. Bu kadar kötü şartlar altında 18 Mayıs 1799 tarihinde Fransa ordusu Akka Kalesi’ne son bir genel hücum yapmayı denedi. Ancak bu hücum da başarısız oldu. 20 Mayıs’ta Napolyon geri çekilme kararı aldı ve Akka kuşatması bitmiş oldu. Napolyon Mısır’a yaptığı saldırıdan beri ilk kez yenilmişti. Ancak savaş daha bitmemişti. Napolyon geri çekilirken bazı topları kullanılmaz hale getirip Akka önlerinde bıraktı 40 parça kadar sahra topunu alarak önce Yafa’ya oradan da Gazze’ye çekildi. Napolyon 13.000 kadar askeriyle 30.000 kadar Osmanlı askerinin koruduğu ve başında Cezzar Ahmet Paşa’nın bulunduğu Akka Kalesi’nden eli boş dönüyordu. Gazze’den sonra Fransızlar Sina Çölü’nü aşıp zor da olsa Kahire’ye vardılar.  

Napolyon ne zaman Akka’dan geri çekildi?