Çandarlı Halil hakkında İstanbul Kuşatması sırasında Bizans'da yardım etti veya casuluk yaptığı konusunda önemli şüpheler vardı. Ve bu şüpheler ortaya çıkartan şey, Megadük Lokas Nutaras'ın itirafları olmuştu. Onun itirafları Çandarlı Halil ile sürekli olarak haberleşme halinde olduğu yönündeydim. Bu açıklamadan sonra Çandarlı Halil öncelikle mallarını el konuldu ardından da hapse atıldı. En sonunda devlet içinde önemli bir hain ortaya çıkmıştı İstanbul Kuşatması sayesinde. Fethi ile birlikte hainler ortaya çıkmıştı.

Tabii ki de Çandarlı Halil hemen idam edileceğini de inanmıyordu. Hapsı atılması onun için idam edeceği anlamına gelmemişti. Çünkü 154 yıldır bir şekilde ailesinden olanlar saltanata yakın konumlarda görebilirdi. Ancak durum öyle olmadı. Çandarlı Halil az edildikten birkaç gün sonra infaz edildi. Ve infaz ederken söylediği sözlerden birisi de Zanus Paşa'nın iki elinin yakasında olacağı oldu. Yani buradan da şunu anlayabiliriz ki muhtemelen Çandarlı Halil'in idamında Osmanlı Devlet Kademesi'ndeki çekişmelerinde büyük etkisi vardı. Çandarlı Halil Paşa belki de devlet içinde bir komplo'ya kurban gitmişti. Belki gerçekten haindi. Neyin ne olduğunu bu kadar şeye bakarak anlamak zor. Belki de ihanetin ortaya çıkaran devlet içindekiler olmuştu. Bilemeyiz. Ama onun ölümü gerçekten de Osmanlı Devlet Kademesi'nde pek çok şeyi değiştirdi. 154 yıldır saltanata yakın olan bir ailenin sonunu getirdi.